Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms