Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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CIPCQ9C0C6 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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CIPCQ9C0C6 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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CIPCQ9C0C6 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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