Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 SLC8A1-206ENST00000406391 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LHX8Q68G74 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms