Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms