Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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