Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms