Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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