Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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