Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
DMDP11532 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
DMDP11532 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
DMDP11532 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
DMDP11532 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DMDP11532 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DMDP11532 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms