Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms