Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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HERC1Q15751 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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HERC1Q15751 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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HERC1Q15751 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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HERC1Q15751 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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HERC1Q15751 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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HERC1Q15751 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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HERC1Q15751 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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