Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms