Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms