Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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