Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SH3BP1Q9Y3L3 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SH3BP1Q9Y3L3 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SH3BP1Q9Y3L3 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SH3BP1Q9Y3L3 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SH3BP1Q9Y3L3 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SH3BP1Q9Y3L3 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SH3BP1Q9Y3L3 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SH3BP1Q9Y3L3 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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