Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms