Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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