Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL4AQ13619 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms