Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RAB39AQ14964 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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