Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms