Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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