Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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