Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms