Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms