Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms