Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms