Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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USP20Q9Y2K6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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USP20Q9Y2K6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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USP20Q9Y2K6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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USP20Q9Y2K6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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USP20Q9Y2K6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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USP20Q9Y2K6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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USP20Q9Y2K6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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USP20Q9Y2K6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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USP20Q9Y2K6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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USP20Q9Y2K6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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USP20Q9Y2K6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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