Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOD1Q9Y239 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms