Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms