Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms