Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms