Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms