Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXL4Q9UKA2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms