Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms