Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms