Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD3Q9P035 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms