Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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