Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms