Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms