Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms