Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MEPEQ9NQ76 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MEPEQ9NQ76 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MEPEQ9NQ76 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MEPEQ9NQ76 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MEPEQ9NQ76 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MEPEQ9NQ76 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MEPEQ9NQ76 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MEPEQ9NQ76 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MEPEQ9NQ76 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MEPEQ9NQ76 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MEPEQ9NQ76 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms