Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms