Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms