Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC9

ZFYVE28, Lateral signaling target protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE28Q9HCC9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE28Q9HCC9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE28Q9HCC9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms