Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPJQ9HC77 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms