Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ELP3Q9H9T3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms