Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKRIP1Q9H875 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms