Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms