Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BCAS3Q9H6U6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms