Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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